Protein–RNA interactions for Protein: P98164

LRP2, Low-density lipoprotein receptor-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 4,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2P98164 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LRP2P98164 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP2P98164 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP2P98164 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP2P98164 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LRP2P98164 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LRP2P98164 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LRP2P98164 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LRP2P98164 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms