Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMO4P61968 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMO4P61968 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms