Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1P60507 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms