Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX16P57768 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX16P57768 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX16P57768 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms