Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRCA2P51587 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCA2P51587 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms