Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms