Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLD1P28340 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD1P28340 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD1P28340 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms