Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USF1P22415 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USF1P22415 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USF1P22415 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF1P22415 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF1P22415 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF1P22415 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF1P22415 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF1P22415 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USF1P22415 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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