Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASTP20810 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASTP20810 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASTP20810 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASTP20810 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASTP20810 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASTP20810 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASTP20810 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASTP20810 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASTP20810 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms