Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNB1P20700 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms