Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms