Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI3P10071 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI3P10071 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI3P10071 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms