Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD2P0DJD1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms