Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEFMP07197 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFMP07197 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFMP07197 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms