Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSD2O96028 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSD2O96028 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSD2O96028 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSD2O96028 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSD2O96028 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSD2O96028 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSD2O96028 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSD2O96028 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSD2O96028 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms