Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNTO95613 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNTO95613 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCNTO95613 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms