Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD4O60885 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRD4O60885 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRD4O60885 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRD4O60885 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRD4O60885 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRD4O60885 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD4O60885 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD4O60885 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD4O60885 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms