Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms