Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf172C9J069 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms