Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt16Q9Z2K1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt16Q9Z2K1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt16Q9Z2K1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt16Q9Z2K1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt16Q9Z2K1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms