Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6aQ9Z101 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6aQ9Z101 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pard6aQ9Z101 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pard6aQ9Z101 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms