Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Xpr1Q9Z0U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Xpr1Q9Z0U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xpr1Q9Z0U0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xpr1Q9Z0U0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xpr1Q9Z0U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xpr1Q9Z0U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xpr1Q9Z0U0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xpr1Q9Z0U0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms