Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn3Q9WUK7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn3Q9WUK7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn3Q9WUK7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms