Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn4Q9WU22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpn4Q9WU22 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn4Q9WU22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms