Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sorbs3Q9R1Z8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sorbs3Q9R1Z8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms