Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfwd2Q9R1A8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfwd2Q9R1A8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfwd2Q9R1A8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms