Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo1Q9QZ11 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exo1Q9QZ11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Exo1Q9QZ11 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo1Q9QZ11 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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