Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nphp1Q9QY53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nphp1Q9QY53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nphp1Q9QY53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp1Q9QY53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp1Q9QY53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nphp1Q9QY53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms