Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snai3Q9QY31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai3Q9QY31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snai3Q9QY31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snai3Q9QY31 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms