Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Msrb1Q9JLC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msrb1Q9JLC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msrb1Q9JLC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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