Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpf2Q9JJ80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpf2Q9JJ80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpf2Q9JJ80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpf2Q9JJ80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpf2Q9JJ80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpf2Q9JJ80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms