Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIY5

Htra2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra2Q9JIY5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htra2Q9JIY5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Htra2Q9JIY5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htra2Q9JIY5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htra2Q9JIY5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Htra2Q9JIY5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htra2Q9JIY5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Htra2Q9JIY5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Htra2Q9JIY5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Htra2Q9JIY5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htra2Q9JIY5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htra2Q9JIY5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms