Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim2Q9ESN6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim2Q9ESN6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim2Q9ESN6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim2Q9ESN6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms