Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr9Q9EQU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr9Q9EQU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr9Q9EQU3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr9Q9EQU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr9Q9EQU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr9Q9EQU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms