Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlr1Q9EPQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr1Q9EPQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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