Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc46a3Q9DC26 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc46a3Q9DC26 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc46a3Q9DC26 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms