Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ftsj3Q9DBE9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ftsj3Q9DBE9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ftsj3Q9DBE9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ftsj3Q9DBE9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ftsj3Q9DBE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms