Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lin37Q9D8N6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lin37Q9D8N6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lin37Q9D8N6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lin37Q9D8N6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms