Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn9Q9D805 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn9Q9D805 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn9Q9D805 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn9Q9D805 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms