Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nop56Q9D6Z1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nop56Q9D6Z1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nop56Q9D6Z1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nop56Q9D6Z1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nop56Q9D6Z1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms