Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33aQ9D2N9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33aQ9D2N9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33aQ9D2N9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33aQ9D2N9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33aQ9D2N9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms