Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc6bQ9D289 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc6bQ9D289 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc6bQ9D289 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms