Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms