Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ift27Q9D0P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ift27Q9D0P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ift27Q9D0P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ift27Q9D0P8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ift27Q9D0P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ift27Q9D0P8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ift27Q9D0P8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ift27Q9D0P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ift27Q9D0P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
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