Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbdc1Q9D0B6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pbdc1Q9D0B6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbdc1Q9D0B6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms