Protein–RNA interactions for Protein: Q9D074

Mgrn1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgrn1Q9D074 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mgrn1Q9D074 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mgrn1Q9D074 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mgrn1Q9D074 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mgrn1Q9D074 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mgrn1Q9D074 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms