Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChtopQ9CY57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ChtopQ9CY57 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChtopQ9CY57 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms