Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb2bQ9CWF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb2bQ9CWF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb2bQ9CWF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb2bQ9CWF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb2bQ9CWF2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms