Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY3Q9CV28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MINDY3Q9CV28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MINDY3Q9CV28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MINDY3Q9CV28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MINDY3Q9CV28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms