Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931417E11RikQ9CR05 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931417E11RikQ9CR05 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
4931417E11RikQ9CR05 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
4931417E11RikQ9CR05 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms